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傳遞窗的機械和電子互鎖功能，確保兩側門不能同時處于開啟狀態，在潔凈室與非潔凈室之間起到緩沖的作用，像實驗室，生物制藥等在使用傳遞窗時都有的操作規程來保障潔凈室不受外界污染。

傳遞窗的操作流程：

1、物料進出潔凈區，應該嚴格與通道分開，由生產車間物料專用通道進出。

2、物料進入時，原輔料由配制班工序負責人組織人員脫包或外表清潔處理后，經傳遞窗送至車間原輔料暫存間;內包材料在其外暫存間拆去外包裝后，經傳遞窗送入內包間。車間綜合員與配制、內包裝工序負責人辦理物料交接。

3、通過傳遞窗傳遞時，應該嚴格執行傳遞窗內外門“一開一閉”的規定，兩門不能同時開啟。開外門將物料放入后先關門，再開內門將物料拿出，關門，如此循環。

4、潔凈區內的物料送出時，應先將物料運送至的物料中間站內，按物料進入時的相反程序移出潔凈區。

5、所有半成品從潔凈區運出，均需從傳遞窗送至外暫存間，經物流通道轉運至外包裝間。

6、極易造成污染的物料及廢棄物，均應從其專用傳遞窗運到非潔凈區。

7、物料進出結束后，應及時清理各清包間或中間站的現場及傳遞窗的衛生，關閉傳遞窗的內外通道門，做好清潔消毒工作。